Au XVIIe siècle, elle possède des dépendances dans 66 paroisses réparties sur six diocèses. On peut citer les établissements suivants :
Pont d’Oust, Les Fougerêts (Morbihan),
Temple de la Coeffrie, Messac (arrd. Redon, Ille-et-Vilaine),
Hôpital de St Jean de Villenart (Ploërmel),
Temple de l’Hôpital (Malansac),
Temple du Guerno (Noyal-Muzillac),
Temple vieux et neuf de Limerzel,
Temple de Fescal (Péaule),
Temple de Saint-Jean (Questembert),
Temple de la Vraie Croix (Morbihan),
Temple de Gorvello (Sulniac, Morbihan),
Saint-Jean de Lantiern (Morbihan),
Hôpital du Quessoy (Côte d’Armor), comprenant plusieurs petits établissements.
L’administration temporelle et spirituelle était confiée à un commandeur. Il exerçait le droit de haute, moyenne et basse justice (droit de juger les délits importants, les intérêts civils et de faire régner l’ordre).
En 1596, pendant les guerres de la Ligue, les partisans du duc de Mercœur ravagent le bourg du Temple. Le logis des commandeurs est détruit. Il ne sera pas restauré. Leur résidence est transférée à la Coëffrie en Messac, mais la juridiction demeure à Carentoir jusqu’à la Révolution.